南京大数据研究院位于科技楼1号楼18层，由金陵科技学院与江宁高新区于合作共建。依托软件学院，旨在将大数据研究院建设成为大数据研究创新平台，完成相关人才培养、科研产出和社会服务成果。

目前，大数据研究院已形成“大数据理论与应用”和“人工智能理论与应用”两个重点研究方向。已有10多名教师和50多名学生参与大数据研究院项目研究。2018年科研合同经费约350万，实际到账科研经费198万，其中“中国网上展览中心”合同金额达200万，“雨花干部学院智慧学院”合同金额达70万，2019年在研项目有8项，合同经费约400万。项目主要为南京市相关部门定向研究服务，受到市相关部门的重视，进展情况得到好评，提升了学校与南京的融合度和贡献度。